在微观世界里，细菌类、真菌类和病毒类已幻化成具有人类外在形态的拟人形——尽管是千奇百怪、形态各异的拟人形。代表正义力量的基因山小伯爵和童子军，他们与微观世界形形色色的邪恶拟人形，尤其是以萨斯王和侏儒萨为代表的病毒拟人形，展开了激烈的斗争，演绎出了一幕幕既波澜壮阔又扑朔迷离、充满神秘色彩的魔幻好戏。 作品也有科幻成分，作品中三个大的场景“原核七星州”，“真核魔幻城”和“病毒联邦凑合国”，分别对应着微观世界的三个真实的领域，即细菌类，真菌类和病毒类的世界。作品中原核七星州的七大家族，实际上是细菌七个大类的喻指。主要人物形象中，特警青眉小管是青霉素的化身。以林惕沙为首的五名童子军中，林姓开头的四人暗指人体免疫细胞中的淋巴细胞。林惕沙和林惕记，暗指人类免疫细胞中的“T”（惕）族细胞；林碧浆和林碧记，暗指人类免疫细胞中的“B”（碧）族细胞；单小宝，则是人类单核细胞中的巨噬细胞的喻指。至于基因山小伯爵，则含有更深的寓意，暗喻这人类将通过基因手段来改造微观世界，并彻底战胜微观世界的侵害。
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